請問如何分析一個基因中的迴文結構?

題目:

請問如何分析一個基因中的迴文結構?

解答:

盼各位大牛提供點思路!謝謝了!迴文結構序列是指順讀和反讀都一樣的序列,廣泛存在於各種生物體基因組中.它可以在質粒、病毒和細菌基因組DNA以及真核染色體和細胞器中找到,並且廣泛分布於人類癌細胞中.很多蛋白質的結合位點是迴文結構:轉錄因子的結合位點,還有終止子也通常是迴文結構.編碼小RNA和其它非翻譯RNA的基因很多片段也是迴文結構.很多功能位點都是迴文結構.
有幾篇文獻供參考.
Computational Methods in Science and Technology 5, 21-24 (1999)SEARCHING FOR PALINDROMIC SEQUENCES IN PRIMARY STRUCTURE OF PROTEINS
Palindrome Patterns in Genomes Arthur Chun-Chieh Shih, D. T. Lee , Chi-Fang Chin, Hong-Yuan Mark Liao, and Wen-Hsiung Li
bioinformatics 2000 vol 16 no 11 page 968-977
BBRC 316 (2004) 755–762 The relationship between palindrome avoidance and intragenic codon usage variations: a Monte Carlo study Anders Fuglsang
BBRC 310 (2003) 280–285 Distribution of potential type II restriction sites
(palindromes) in prokaryotes Anders Fuglsang
Theoretical comupter science 292 (2003) 9-31
Pattern Recognition 35 (2002) 2581–2591 Finding approximate palindromes in strings
你講的是DNA或者RNA的.蛋白質的迴文序列有沒?謝了.
qigai wrote:迴文結構序列是指順讀和反讀都一樣的序列,廣泛存在於各種生物體基因組中.它可以在質粒、病毒和細菌基因組DNA以及真核染色體和細胞器中找到,並且廣泛分布於人類癌細胞中.很多蛋白質的結合位點是迴文結構:轉錄因子的結合位點,還有終止子也通常是迴文結構.編碼小RNA和其它非翻譯RNA的基因很多片段也是迴文結構.很多功能位點都是迴文結構.
有幾篇文獻供參考.

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